NetBeansはプロジェクトにはエンコーディングを指定できるのですが、ファイルごとには指定するオプションがありません。 指定したエンコーディングでファイルを開くプラグインが（おそらく結構前から）ありますが、プラグインポータルには登録されず、NetBeansのbugzilla内にひっそりとファイルが添付されているだけです。
わかりにくいのでオリジナルのコードをクローンして、ソースコードをgithub上にアップしました。
NetBeans Encoding Plugin
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